La quinua (Willd.) ha recibido recientemente un interés creciente tanto de científicos como de consumidores debido a su idoneidad en dietas sin gluten, su sostenibilidad y sus supuestas cualidades de superalimento. El objetivo de este documento es revisar sistemáticamente estudios actualizados sobre los componentes funcionales y factores antinutricionales de la quinua, con el fin de definir una línea base para los científicos de alimentos que se acerquen a la investigación de fitoquímicos de la quinua y proporcionar evidencia para la identificación de alimentos sostenibles más saludables. Se obtuvieron evaluaciones de vanguardia de los contenidos fitoquímicos en las semillas de quinua. Surgió que los compuestos fenólicos son los componentes funcionales más investigados, y los métodos espectrofotométricos han sido los más aplicados, a pesar de que no proporcionan información sobre componentes individuales. Las saponinas son las más estudiadas entre los factores antinutricionales. Las betalaínas, los taninos y los fitoecdiseroides han sido poco explorados. La información sobre los factores que afectan el contenido fitoquímico en la cosecha, como los ecotipos de quinua, la ubicación geográfica del cultivo y las condiciones de crecimiento, no siempre está disponible. Una caracterización integral, que abarca varias clases de componentes funcionales y factores antinutricionales, está principalmente disponible para las variedades de quinua de América del Sur. Sin embargo, definir un estándar de calidad para las semillas de quinua sigue siendo un desafío y requiere una armonización de los enfoques analíticos, entre otros.