El método de transformación diferencial multietapa se emplea primero para resolver una cinética enzimática fraccional en el tiempo. Esta reacción enzima-sustrato está formada por un sistema de ecuaciones diferenciales ordinarias no lineales de orden fraccional. Las derivadas fraccionarias se describen en el sentido de Caputo. Se presenta un estudio comparativo entre el nuevo algoritmo y el método clásico de Runge-Kutta en el caso de derivadas de orden entero. Los resultados demuestran la confiabilidad y eficiencia del algoritmo desarrollado.