Genes en tándem en los genomas de vertebrados
Autores: Deng, Pan; Liqing, Zhang
Idioma: Inglés
Editor: Hindawi Publishing Corporation
Año: 2008
Disponible con Suscripción Virtualpro
Artículos
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
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Citaciones: Sin citaciones
Los genes dispuestos en tándem (TAG) son genes duplicados que están unidos como vecinos en un cromosoma, muchos de los cuales tienen importantes funciones fisiológicas y bioquímicas. Aquí hemos realizado un estudio de estos genes en 11 genomas de vertebrados disponibles. Los TAG representan una media del 14% de todos los genes en estos genomas de vertebrados, y alrededor del 25% de todas las duplicaciones. La mayoría de los TAG (72-94%) tienen una orientación de transcripción paralela (es decir, están codificados en la misma cadena), en contraste con el genoma, que tiene alrededor del 50% de sus genes en orientación de transcripción paralela. La mayoría de los conjuntos en tándem tienen sólo dos miembros. En todas las especies, la proporción de genes que pertenecen a TAGs tiende a ser mayor en las familias de genes grandes que en las pequeñas; junto con nuestro reciente hallazgo de que la duplicación en tándem desempeñó un papel más importante que la retroposición en las familias grandes, este hecho sugiere que entre todos los tipos de mecanismos de duplicación, la duplicación en tándem es el mecanismo predominante de duplicación, especialmente en las familias grandes. Por último, varias especies tienen una mayor proporción de grandes conjuntos en tándem que son específicos de una especie que la esperada al azar.
Descripción
Los genes dispuestos en tándem (TAG) son genes duplicados que están unidos como vecinos en un cromosoma, muchos de los cuales tienen importantes funciones fisiológicas y bioquímicas. Aquí hemos realizado un estudio de estos genes en 11 genomas de vertebrados disponibles. Los TAG representan una media del 14% de todos los genes en estos genomas de vertebrados, y alrededor del 25% de todas las duplicaciones. La mayoría de los TAG (72-94%) tienen una orientación de transcripción paralela (es decir, están codificados en la misma cadena), en contraste con el genoma, que tiene alrededor del 50% de sus genes en orientación de transcripción paralela. La mayoría de los conjuntos en tándem tienen sólo dos miembros. En todas las especies, la proporción de genes que pertenecen a TAGs tiende a ser mayor en las familias de genes grandes que en las pequeñas; junto con nuestro reciente hallazgo de que la duplicación en tándem desempeñó un papel más importante que la retroposición en las familias grandes, este hecho sugiere que entre todos los tipos de mecanismos de duplicación, la duplicación en tándem es el mecanismo predominante de duplicación, especialmente en las familias grandes. Por último, varias especies tienen una mayor proporción de grandes conjuntos en tándem que son específicos de una especie que la esperada al azar.