La fluorescencia de la clorofila es interesante para aplicaciones de fenotipado ya que está llena de información biológica y se puede medir de forma remota y no destructiva. Hay varias técnicas para medir y analizar esta señal. Sin embargo, los métodos estándar utilizan condiciones bastante extremas, por ejemplo, luz saturante y adaptación a la oscuridad, que son difíciles de adaptar en el campo o en un invernadero y, por lo tanto, limitan su uso para el fenotipado de alto rendimiento. En este artículo, utilizamos un enfoque diferente, extrayendo información sobre la salud de las plantas a partir de la dinámica de la fluorescencia de la clorofila inducida por una excitación de luz débil y sin adaptación a la oscuridad, para clasificar las plantas como saludables o no saludables. Para evaluar el método, escaneamos varias especies (lechuga, melisa, tomate, albahaca y fresas) expuestas a factores de estrés abiótico (sequía y sal) o factores de estrés biótico (infección de raíces y hojas utilizando el mildiú polvoriento). Nuestras conclusiones son que, para el estrés abiótico, el método propuesto fue muy exitoso, mientras que, para el mildiú polvoriento, sería deseable un método con resolución espacial debido a la naturaleza de la infección, es decir, la propagación punto a punto. La infección en las raíces no es detectable visualmente de la misma manera que el mildiú polvoriento; sin embargo, afecta a toda la planta, lo que hace que el método sea una opción interesante para la detección. Sin embargo, se necesita más investigación para determinar el límite de infección necesario para detectar el estrés con el método propuesto.