El análisis de isótopos de cloro estables específico de compuestos (CSIA-Cl) es un método importante para identificar fuentes de contaminantes organoclorados y ayudar a evaluar su cuantificación de los procesos de transformación. Sin embargo, el CSIA-Cl actual se enfrenta al reto de un pretratamiento de conversión redundante o de una corrección matemática complicada. Para superar los problemas mencionados, en este estudio se ha desarrollado un método novedoso para la CSIA-Cl de ocho plaguicidas organoclorados mediante cromatografía de gases-espectrometría de masas de ionización química negativa (GC-NCI-qMS). Los parámetros del instrumento, el modo de adquisición y las cantidades de inyección requeridas se optimizaron en función de la precisión de la GC-NCI-qMS. Se seleccionaron una energía de ionización de 90 eV y una corriente de emisión de 90 μA, y las precisiones para ocho plaguicidas organoclorados se situaron en el intervalo de 0,37‰-2,15‰ en el modo de monitorización de ion único (SIM) cuando la cantidad inyectada fue de 0,50 mg L-1 (es decir, 0,5 ng en columna). Además, cuando los estándares de Supelco y O2si se calibraron utilizando estándares de AccuStandard considerados como estándar isotópico externo, se diferenció con seguridad la composición isotópica de cloro del α-hexaclorociclohexano (α-HCH) y del 2, 2-dicloro-1, 1-bis (4-clorofenil) etileno (p, p′-DDE) en Supelco y O2si. El método de identificación de la procedencia se validó con tres muestras de aguas subterráneas contaminadas con organoclorados y demostró su capacidad para identificar la fuente de los plaguicidas organoclorados.